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% mate-power-manager --version
Version 1.8.1

で、mate-sessionを起動すると$HOME/mate-power-manager.core ができています。同じような現象の方が大勢いらっしゃるようで。
(https://bugs.freebsd.org/bugzilla/show_bug.cgi?id=193942 とか)
sysutils/mate-power-managerのバグなんでしょうか？
ひとまずmate-power-managerはなくても構わないので、メニューの
「システム」→「設定」→「自動起動するアプリ」から『電源の管理』を外すことで対処しました。※同時に『スクリーンセーバー』もoffになり、コンピュータのロックができなくなります
※自分は仮想マシン上で使用しているので影響なしなんですけども